L'arte di Mario Fanconi si armonizza perfettamente con l'ambiente, sfumando da l'uno a l'altro, riverbera l'unità delle parti. La tecnica raffinata e lo stile di richiamo impressionista, rendono godibili alla vista tutte le sue opere.

Il suo elemento distintivo è proprio il tratto: il suo desiderio è quello di voler sottolineare ed evidenziare i lineamenti delle foglie, dei volti e dei contorni, con colore o con assenza di colore, per rimarcare ancora una volta l'importanza del tema da lui affrontato.

Nei soggetti di Mario Fanconi viene rappresentato l'uomo in rapporto alla natura che lo circonda, la sua visione estetica di scene comuni riflesse nello sguardo dell'autore, in cui entrano in contatto natura ed artificio umano in questa esperienza unica che è la vita.

Le sue macchie di colori sono tra le cose più belle che ha prodotto, plasmati da diverse tecniche, i suoi quadri sono un tranquillizzante, mai aggressivo o violento, di immagini distese e silenziose, che sanno ritagliare un angolo di pace in una società che ha fatto della violenza e della volgarità i suoi vessilli.

Dopo la sua morte la sua arte è stata riconosciuta attraverso l'ottenimento di premi, e riconoscimenti per la sua bravura.